基于转录组学和蛋白质组学的高海拔肺动脉高强度大鼠模型的新靶点

肺部高压（PH）是所称静息时平均肺部压≥25 mmHg。 它根据脑组织动力讲授形态、复发选择性和生物化讲授统称五类。 第三类高山地肺部高压（HAPH）是由于在高山地减压环境里面肺呼吸量代偿性增加和肺小动脉水肿引起的，导致高原心肌病。 临床研究症状包括灵活性呼吸困难、头痛和疲劳。 HAPH 或许反映了未能直接影响以高山地，并伴有不清楚的病因生理选择性。 大约有 1.4 亿人生活在山地 2,500 米以上的海地区，每年有至少 4,000 万人访问这些高山地海地区。 减压导致器官基因序列隐含曲谱发生不同转变； 这都是长期聚居在高山地海地区的居民及其数代的基因序列型直接影响以性转变里面得知的。HAPH 的疗法仍在讲授术研究里面。应以表示同意病变移往低山地海地区，氧疗必需。口服疗法的讲授术研究仅限于一些随机实验。 HAPH 的病因与其他类型的 PH 相似，因此值得权衡对 PAH 必需的口服是否是对 HAPH 必需。

然而，所有这些凋亡口服都在HAPH里面的必需性和选择性已为不清楚。为知晓决这个问题，我们有助于讲授术研究减压所包括的分子可选择性，运用于豚鼠 HAPH 模型，并应以用总合多四组讲授工具。 在此过程里面，我们有助于讲授术研究几种凋亡口服和复氧的作用，以确定高山地引起的减压的潜在新疗法靶点。 特别是，我们讲授术研究了凋亡口服如何影响器官之间的不同基因序列和酵素隐含。

讲授术研究设计：

将豚鼠放到 10% O2（减压）会议室里面 3 年后显现出 PH。对照豚鼠（C 四组）在整个物理里面都处于常氧环境下，并在疗法期间（即从第 21 天开始）用载体来进行疗法。 3亦同，其余豚鼠随机统称六四组；一四组被杀害（第 21 天）以评估心肺基本功能。其余 5 四组用凋亡口服或复氧疗法，从第 21 天到第 35 天杀害。慢性减压，载体处理（M）；慢性减压，司来帕格疗法；慢性减压，巴德替坦疗法；慢性减压，riociguat 疗法；慢性减压、复氧 (RE)。

酪氨酸四组系统性：

所含总 RNA，并通过运用于 Arraystar rRNA Removal Kit 转换成 rRNA 来富集 mRNA 和非编码 RNA。 mRNA 和非编码 RNA 被段落化苯甲酸分解成短段落（~200-500 nt）。以短段落为codice_，利用随机六聚体引物多肽第一肽键cDNA。在第二肽键多肽过程里面，dTTP 被 dUTP 取代。 然后加入洗脱苯甲酸以通过尾端重建和添加腺嘌呤来转化和分离短段落。 短段落被转化并与链条通到； 运用于尿嘧啶-N-糖基化核糖体降解第二条肽键。 琼脂糖凝胶电泳后，选择合适的段落作为codice_来进行PCR扩增。 运用于 Agilent 2100 生物探头和 ABI StepOnePlus 可实现 PCR 具体来说试样库来进行分析工具和质量评估。 该月号运用于 Illumina HiSeq 2000 系统来进行测序。

LC-MS/MS 系统性

在通到到 Easy-nLC 1000 液相色曲谱系统的Q Exactive HF 质曲谱仪上系统性试样。将干燥的酪氨酸试样重新沉淀在甲苯 A（0.1% 碳酸溶剂）里面并加载到捕集柱里面运用于甲苯 A 的最大压力为 280 bar，然后在；还有的 150 μm × 30 cm 乙二醇微柱上以 5–35% 的径向来进行分离流动相 B（碳酸和 0.1% 碳酸），流量为 600 nl/min，持续 150 分钟。 QE HF 的 MS 系统性是在 3e6 金属离子的自动增益控制目标下来进行一次全显像，然后来进行多达 30 次与数据相关的 MS/MS 显像较强更高光子的交互作用沉淀，在 Orbitrap 里面检测到（R = 15,000 在 200 m/z）。

讲授术研究结果：

基于RNA-seq数据的共隐含网络的基本功能富集系统性和交通枢纽分子可鉴定。

基于酵素数据的共隐含网络的基本功能富集系统性和交通枢纽分子可鉴定。

RNA-seq 和酵素四组讲授揭示了对三种口服的反应以之间的强相关性，较强基本上相同的缺点。GO 富集表明不同隐含的基因序列包括直接参与激素调节、酪氨酸和翻译的基因序列。

司来帕格、巴德替坦和复氧可改善 HAPH。Serpina1、Cryz 和 Cmc1 被鉴定出来，通过多四组讲授筛选，作为直接参与HAPH的极其重要基因序列。这些发现为 HAPH 的凋亡口服选择性提供了新的哲讲授思想。

讲授术研究结论：

Selexipag、macitentan 和复氧显着减弱了豚鼠 HAPH 模型，而 riociguat 的作用较弱。 不同隐含的基因序列直接参与激素调控、酪氨酸和翻译。 某些酵素受到 HAPH 和疗法的影响。 我们运用于多四组讲授工具筛选了极其重要基因序列 Serpina1、Cryz 和 Cmc1。 这些发现或许适度更好地知晓减压所包括的分子可选择性，并或许提供新的疗法靶点。

文献原文：

Xu X, Li H, Wei Q, Li X, Shen Y, Guo G, Chen Y, He K, Liu C. Novel Targets in a High-Altitude Pulmonary Hypertension Rat Model Based on RNA-seq and Proteomics. Front Med (Lausanne). 2021 Nov 3;8:742436. doi: 10.3389/fmed.2021.742436. PMID: 34805208; PMCID: PMC8595261.